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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
09/06/2021 |
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Data da última atualização: |
09/11/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PESSOA, D. D. V.; SANTOS, C. M. dos; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M. de; ARAUJO, J. L. S. de. |
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Afiliação: |
DANIELLA DUARTE VILLARINHO PESSOA, UFRRJ; CARLOS MAGNO DOS SANTOS, UFRRJ; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; MICHELLE ZIBETTI TADRA-SFEIR, UFPR; EMANUEL MALTEMPI DE SOUZA, UFPR; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB. |
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Título: |
Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 expression profile in response to sugarcane apoplastic fluid. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
3 Biotech, v. 11, Article number 292, 2021. |
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ISSN: |
2190-5738 |
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DOI: |
10.1007/s13205-021-02848-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Bacterial transcriptome profiling in the presence of plant fluids or extracts during microbial growth may provide relevant information on plant?bacteria interactions. Here, RNA sequencing (RNA-Seq) was used to determine the transcriptomic profile of Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 at the early stages of response to sugarcane apoplastic fluid. Differentially expressed gene (DEG) analysis was performed using the DESeq2 and edgeR packages, followed by functional annotation using Blast2GO and gene ontology enrichment analysis using the COG and KEGG databases. After 2 h of sugarcane apoplastic fluid addition to the H. seropedicae HRC54 culture, respectively, 44 and 45 genes were upregulated and downregulated. These genes were enriched in bacterial metabolism (e.g., oxidoreductase and transferase), ABC transporters, motility, secretion systems, and signal transduction. RNA-Seq expression profiles of 12 genes identified in data analyses were verified by RT-qPCR. The results suggested that H. seropedicae HRC54 recognized sugarcane apoplastic fluid as the host signal, and some DEGs were closely involved at the early stages of the establishment of plant?bacteria interactions. |
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Palavras-Chave: |
Plant bacteria interactions. |
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Thesaurus Nal: |
Sugarcane. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 73 | |
| 3. |  | MIYAUCHI, C. A. C.; FERNANDES, C. A. C.; OLIVEIRA, E. R.; ALVES, B. F. L.; VIANA, J. H. M. Effect of follicular wave synchronization and absence of corpus luteum on coc recovery in gyr (Bos taurus indicus) cows. Reproduction, Fertility and Development, v. 22, n. 1, 2010. Edição dos proceedings do Annual Conference of the International Embryo, 2010, Cordoba.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 4. | | FERREIRA, A. M.; SA, W. F.; VIANA, J. H. M.; FERNANDES, C. A. C.; CAMARGO, L. S. A. Taxa de nao retorno ao cio em 60 dias e taxa de prenhez em bovinos. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 49, n. 2, p. 261-267, 1997.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | VIANA, J. H. M.; PEREIRA, N. E. S.; FARIA, O. A. C.; DIAS, L. R. O.; OLIVEIRA, E. R.; FERNANDES, C. A. C.; SIQUEIRA, L. G. B. Active immunization against GnRH as an alternative therapeutic approach for the management of Bos indicus oocyte donors diagnosed with chronic cystic ovarian disease. Theriogenology, v. 172, p. 133-141, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 6. | | VARAGO, F. C.; SILVA, L. P.; RIBEIRO, J. R.; FERNANDES, C. A. C.; CARVALHO, B. C. de; GIOSO, M. M.; GIMENEZ, M.; NEVES, J. P. Acrosome reaction induced by theophylline associated or not to heparin in bovine semen Animal Reproduction, v. 12, n. 3, 2015. Edição dos proceedings do 29º Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society, 2015, Gramado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | ROSSI, T. C.; CAMARGO, L. S. de A.; FERNANDES, C. A. C.; VARAGO, F. C.; MIYAUCHI, T. M.; ROSSI, J. R.; GIOSO, M. M. Bovine oocyte transportation in environment with or without control gas atmosphere. Animal Reproduction, v. 10, n. 3, p. 547, Jul./Sept. 2013. Suplemento. Edição dos abstracts do 27º Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society, 2013, Praia do Forte, BA.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 8. | | GHETTI, A. M.; BRANDAO, F. Z.; SIQUEIRA, L. G. B.; AREAS, V. S.; ARASHIRO, E. K. N.; FERNANDES, C. A. C.; PALHAO, M. P.; VIANA, J. H. M. Comparação dos metodos e subjetivo de avaliação do padrão vascular do foliculo pre-ovulatorio utilizando-se Doppler colorido. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE EMBRIÕES, 26., 2012, Foz do Iguaçu. Anais. Belo Horizonte: CBRA, 2012. p. 478.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | SIQUEIRA, L. G. B.; AREAS, V. S.; GHETTI, A. M.; FONSECA, J. F. da; PALHAO, M. P.; FERNANDES, C. A. C.; VIANA, J. H. M. Color Doppler flow imaging for the early detection of nonpregnant cattle at 20 days after timed artificial insemination. Journal of Dairy Science, v. 96, n. 10, p. 6461-6472, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Leite. |
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| 10. | | VIANA, J. H. M.; CAMARGO, L. S. A.; SIQUEIRA, L. G. B.; SOUZA, E. D.; FREITAS, C.; FERNANDES, C. A. C. Characteristics of the superovulatory response in Gyr (Bos Indicus) cattle. Reproduction, Fertility and Development, v. 19, n. 1, p. 311-312, 2007. Edição dos proceedings do Annual Conference of the Internatinal Embryo Transfer Society, 2007, Kyoto.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | FERNANDES, C. A. C.; OLIVEIRA, E. R.; VASCONCELOS, T. D.; ALVES, B. F. L.; GIOSO, M. M.; VIANA, J. H. M.; OBA, E.; FIGUEIREDO, A. C. S. Bipartição de embriões bovinos em diferentes estádios de desenvolvimento. Acta Scientiae Veterinariae, v. 35, p. s1215, 2007. Supl. 3. Edição dos anais da 21ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, Salvador, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | FERNANDES, C. A. C.; FIGUEIREDO, A. C. S.; OLIVEIRA, E. R.; VASCONCELOS, T. D.; ALVES, B. F. L.; GIOSO, M. M.; VIANA, J. H. M.; OBA, E. Estrus detection efficiency in embryo recipients synchronized with cloprostenol Acta Scientiae Veterinariae, v. 34, s493, 2006. Supl. 1. Edição dos resumos da 20ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, Araxá, 2006.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 13. | | ARASHIRO, E. K. N.; SIQUEIRA, L. G. B.; VIANA, J. H. M.; FONSECA, J. F.; BRUSCHI, J. H.; CAMARGO, L. S.; FERNANDES, C. A. C.; BRANDÃO, F. Z. Estudo ultra-sonográfico de características luteais no período de luteogênese em cabras da raça Toggenburg. Acta Scientiae Veterinariae, v. 35, p. s1291, 2007. Supl. 3. Edição dos anais da 21ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, Salvador, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Leite. |
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| 15. | | GUIMARÃES, C. R. B.; OLIVEIRA, M. E.; ROSSI, J. R.; FERNANDES, C. A. C.; VIANA, J. H. M.; PALHAO, M. P. Corpus luteum blood flow evaluation on Day 21 to improve the management of embryo recipient herds. Theriogenology, v. 84, n. 2, p. 237-241, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 16. | | PALHÃO, M. P.; JUNIOR, N. S.; GUIMARÃES, C. R. B.; FERNANDES, C. A. C.; FERREIRA, M. E. O.; SEBER, M.; REIS, W. S. M.; VIANA, J. H. M. Follicular growth and blood flow of the dominant follicle in crossbred recipients treated with eCG. In: ANNUAL CONFERENCE OF THE INTERNATIONAL EMBRYO TRANSFER SOCIETY, 2013, Hannover. Proceedings... Hannover: [s.n.], 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. | | FERNANDES, C. A. C.; FIGUEIREDO, A. C. S.; OLIVEIRA, E. R.; VASCONCELOS, T. D.; ALVES, B. F. L.; GIOSO, M. M.; VIANA, J. H. M. Folltropin-V® dose trial on superovulation protocol in european beef cows. Acta Scientiae Veterinariae, v. 34, s514, 2006. Supl. 1. Edição dos resumos da 20ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, Araxá, 2006.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 18. | | PALHAO, M. P.; OLIVEIRA, E. R.; GIOSO, M. M.; CARVALHO, B. C. de; SIQUEIRA, L. G. B.; FERNANDES, C. A. C.; VIANA, J. H. M. The relationship between oocyte recovery and embryo production in Bos indicus. In: ANNUAL CONFERENCE OF THE INTERNACIONAL EMBRYO TRANSFES SOCIETY, 2012, Phoenix. Proceedings... [S.l.:s.n.], 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 19. | | FERNANDES, C. A. C.; PEREIRA, G. H. S.; SIQUEIRA, L. G. B.; NERI, H. L. D. H.; VIANA, J. H. M.; PALHAO, M. P.; TEODORO, R. A. S. Short communication: does previous superovulation affect fertility in dairy heifers? Journal of Dairy Science, v. 103, n. 11, p. 10862-10866, 2020.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 20. | | VIANA, J. H. M.; CAMARGO, L. S. A.; FONSECA, J. F.; OLIVEIRA, A. P.; ARASHIRO, E. K. N.; FREITAS, C.; FERNANDES, C. A. C. Retrospective analysis of cumulus-oocyte complexyield in a gyr (Bos Taurus Indicus) herd undergoing trasvaginal ultrasound-guided fillicle aspiration. In: REPRODUCTION, FERTILITY AND DEVELOPMENT. 20. 2008, Anais. Colorado. Csiro, Academy of Science, 2008. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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